🔬 Top-Karrierechance: Wissenschaftliche Mitarbeiterin / Wissenschaftlicher Mitarbeiter Hochpathogene mikrobielle Erreger (d/m/w) bei Robert Koch-Institut in Berlin

Werden Sie Teil der RKI-DNA!

Das Robert Koch-Institut schützt mit rund 1.500 Beschäftigten aus über 52 Nationen die Gesundheit der Bevölkerung. Wir erheben und analysieren Gesundheitsdaten, erkennen Risiken, beraten Politik und Fachwelt und entwickeln neue wissenschaftliche Methoden an den Standorten Berlin, Wildau und Wernigerode.

Die Mitarbeit erfolgt im Rahmen des vom BMG geförderten Projekts MIRAI zur Sicherstellung der Detektion bioterroristisch relevanter neuartiger Agenzien und synthetischer Wirkmittel.

Im Projekt entwickeln Sie Methoden zur Erkennung, Identifizierung und Charakterisierung unbekannter bakterieller sowie viraler Erreger aus komplexen Matrices und Metagenomdatensätzen.

Unser Fachgebiet ZBS 2 - Hochpathogene mikrobielle Erreger freut sich auf Ihre Bewerbung!

Ihre Aufgaben bei uns

• Eigenverantwortliche Herstellung von NGS-Bibliotheken sowie selbstständige Durchführung von Illumina-Sequenzierungen (MiSeq) inklusive Qualitätskontrolle
• Integration, Interpretation und Validierung molekularbiologischer, mikrobiologischer und bioinformatischer Daten zur Erregercharakterisierung
• Planung, Durchführung und wissenschaftliche Auswertung metagenomischer Analysen sowie Optimierung bioinformatischer Analysepipelines
• Entwicklung und Anwendung KI-gestützter Verfahren zur Identifizierung und Charakterisierung unbekannter bakterieller Erreger
• Konzeption, Koordination und Bearbeitung wissenschaftlicher Fragestellungen sowie Publikation und Präsentation der Ergebnisse

Ihr Profil

Formale Voraussetzungen

• Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master/Diplom/Staatsexamen) der Naturwissenschaften, Veterinärmedizin, Humanmedizin oder vergleichbarer Fachrichtungen
• Promotion erwünscht

Bei ausländischen Bildungsqualifikationen ist ein Nachweis über die Gleichwertigkeit erforderlich.

Kenntnisse und Erfahrungen

• Erfahrung mit Illumina-basierten NGS-Verfahren (Gerätebedienung, Probenvorbereitung, Bibliotheksherstellung, Sequenzierung, Qualitätskontrolle)
• Bioinformatische Auswertung von NGS-Daten, insbesondere bakterieller Genome und Metagenomdaten
• Arbeit in einer Linux-basierten Analyseumgebung (HPC-Cluster)
• Entwicklung, Implementierung und Validierung bioinformatischer Analysepipelines
• Anwendung von KI- und Machine-Learning-gestützten Methoden
• Sprachkenntnisse: Deutsch mind. B2, Englisch mind. C1

Wünschenswert

• Mikrobiologische und molekularbiologische Praxis im Umgang mit Erregern der Risikogruppe 3
• Erfahrung mit Oxford-Nanopore-Sequenzierung
• Programmierkenntnisse in Python und/oder R

Persönliche Kompetenzen

• Eigeninitiative und hohe Motivation
• Zielorientierte Konzeptentwicklung
• Ausgeprägte Team- und Kooperationsfähigkeit
• Konfliktfähigkeit und Lösungsorientierung

Weitere Voraussetzungen

• Bereitschaft zur regelmäßigen Teilnahme an 24/7 Rufbereitschaften (Erreichbarkeit des RKI innerhalb einer Stunde)
• Bereitschaft zur erweiterten Sicherheitsüberprüfung nach § 9 SÜG

Darauf können Sie sich bei uns freuen

Wir leben Chancengleichheit und gewährleisten die berufliche Gleichstellung. Bewerbungen von Menschen aller Diversitätsdimensionen sind ausdrücklich erwünscht. Schwerbehinderte Menschen werden bei gleicher Eignung bevorzugt.